高效的多肽縮合劑一直是多肽領域的研究熱點，也是高效地合成結構越來越具有挑戰性的生物活性肽和多肽類似物的保障。
目前，已報導的多肽縮合劑很多，但影響較大，應用較為廣泛的縮合劑從分子結構角度主要分為碳二亞胺類型、磷正離子類型和脲正離子類型。
1. 碳二亞胺型縮合劑 N,N'-二環己基碳二亞胺(DCC)是于1955年開發出來的第一個碳二亞胺型縮合劑，至今DCC仍是多肽合成中最常用的縮合劑之一。但反應生成的N,N'-二環己基脲(DCU)在大多數有機溶劑中溶解度很小，有時會混在產物中而很難除盡。為此人們在DCC的結構上進行了改進，發展了一些生成水溶性反應副產物的碳二亞胺，如DIC，EDC和BDDC等。通過將碳二亞胺固載在高聚物上得到的縮合劑使反應的后處理更為簡單，例如樹脂固載的EDC(P-EDC). 這類縮合劑由于價格相對較便宜，因而特別適用于多肽的大規模制備。但在進行片段縮合時，往往會導致產物有較大程度的消旋，為此通常與HOSu，HOBt，HOAt，或HOOBt等添加劑一起使用來抑制產物消旋，同時也可有效地抑制N-酰基脲等副產物的生成。在這些添加劑中以HOBt應用最廣。DCC-HOBt復合縮合劑已成為目前應用最廣的縮合方法之一。HOOBt雖然與HOBt相比可更有效地抑制消旋，但會產生疊氮化副產物，從而限制了它的廣泛應用。HOAt是近幾年才發展的新的添加劑，它不僅可以有效地抑制消旋，而且大大提高了反應速度，特別適用于由空間位阻的多肽的合成，但這一試劑價格較貴，不適于多肽的大規模制備。碳二亞胺類縮合劑在多肽合成中的反應中間體主要是O-酰基異脲和羧基組份的對稱酸酐(Fig.3)。產物的消旋主要是因為O-酰基異脲和酸酐的分子內環化形成5(4H)-噁唑酮，它很容易脫去 -質子形成共振穩定的噁唑酮負離子。這種噁唑酮負離子可以從分子平面的兩側重新質子化，進一步與氨基組份反應得到消旋的產物。當加入添加劑時，它們可以攔截高反應活性的O-酰基異脲和酸酐中間體生成相應的活化酯，進一步胺解得到目標產物。
2. 磷正離子型縮合劑 采用酰基磷正離子作為活潑中間體用于形成酰胺鍵是Kenner于1969年首先提出并將這種方法用于多肽的合成，發展出一些能產生此中間體的試劑，如Bate試劑等。這些試劑都因性能較差，產物消旋較大，或操作較復雜而未被廣泛使用。直到1975年Castro設計并合成另一個基于HOBt的磷正離子型縮合劑BOP，這類縮合劑才得到人們的重視，并廣泛用于多肽的固相法和液相法合成中。但BOP在多肽合成中生成的副產物六甲基磷酰胺具致癌毒性，為此后來又發展了副產物毒性低，反應活性相對更高的縮合劑PyBOP，并已實現商品化。這類縮合劑參與多肽合成反應的機理主要是在堿性條件下羧基負離子進攻縮合劑生成的酰氧基磷正離子，繼而此活潑中間體受苯并三唑氧基負離子進攻生成羧基組份的苯并三唑酯，此活化酯再與氨基組份反應得到目標產物。酰氧基磷正離子和生成的少量酸酐也可能直接與氨基組份反應得到相應的肽。盡管這些基于HOBt的磷正離子型縮合劑在含普通氨基酸的多肽的合成中表現出優異的性能，但在有空間位阻的多肽合成中結果卻不令人滿意，產物的收率低并伴有較大程度的消旋。而后來發展起來的基于HOAt的磷正離子和 -鹵代的磷正離子型縮合劑滿足了這一要求，例如AOP，PyAOP，BrOP，PyClOP，PyBrOP等。這些縮合劑可以高效地促進有空間位阻的酰胺鍵的形成，并廣泛用于富含N-甲基氨基酸或C ,C -二烷基化氨基酸的多肽和生物活性肽的合成中。不足的是這些基于HOAt的試劑價格昂貴不適于多肽的大規模制備，而 -鹵代的磷正離子型縮合劑在進行片段縮合時，產物伴有較大程度的消旋，并且對于羧基組份為叔丁氧羰基保護的氨基酸的縮合反應產物的收率很低。
3. 脲正離子型縮合劑 自1978年Dourtoglou成功地將基于HOBt的脲正離子HBTU用于多肽合成中來，這一類型縮合劑得到迅速的發展，并先后開發出一系列基于HOBt、HOAt、HOOBt和HOPyU等的正離子型試劑。例如TBTU、HBPyU、HBPipU、HBMDU、HATU、HAPyU、HAMDU、TAPipU、HDTU、HPyOPfp、HPySPfp、HAPyTU、TOTU、HAPipU。這些縮合劑在多肽合成中均表現出較好的性能，具有反應速度快，產物消旋小、收率高等諸多優點，特別是基于HOBt和HOAt的試劑。其中基于HOAt的脲正離子型縮合劑可有效地促進有空間位阻的酰胺鍵的形成。但是這類基于HOAt的縮合劑在多肽合成中，會與氨基組份反應生成相應的胍衍生物，這一副反應在片段縮合和環肽的合成中是不容忽視的。雖然HBTU、HBPyU等HOBt衍生的脲正離子型試劑幾乎不存在此副反應，但它們在富含N-甲基氨基酸的多肽的合成中產物的收率和旋光純度都較差。在這種情況下， -鹵代脲正離子型縮合劑越來越顯現出其在有空間位阻的多肽合成中的重要地位。在這類縮合劑中以PyCIU、TFFH、BTFFH、CIP，和CTDP應用較為廣泛，并已被成功地用于含有N-甲基氨基酸和C ，C -二烷基化氨基酸的多肽的合成中。遺憾的是這類試劑與 -鹵代磷正離子型縮合劑在片段縮合過程中產物的消旋較大。與磷正離子型縮合劑類似，HOBt和HOAt衍生的脲正離子型縮合劑參與多肽縮合反應的主要中間體分別是羧基組份的苯并三唑酯和7-氮雜苯并三唑酯。當 -鹵代脲正離子型縮合劑參與多肽合成時，反應的活潑中間體主要是羧基組份的酰鹵和酸酐。
4. 其它類型的縮合劑除上述幾大類型的縮合劑外，一些其它類型的縮合劑在多肽合成中也有一定程度的應用，其中有代表性的主要有：BOP-Cl、FDP、FDPP、DEPBT、EDQ等。其中BOP-Cl可以高效地促進有空間位阻的酰胺鍵的形成與消旋較小，并成功地用于富含N-甲基氨基酸的生物活性肽的合成中。但這一縮合劑會與游離的氨基酸反應，特別是黨氨基酸組份是伯胺時，不能通過一鍋法制被多肽。FDP和FDPP都是無氟苯酚衍生物的試劑，在多肽合成中具有產物收率高，后處理簡單的優點，但不適于有空間位阻多肽的合成。FDPP特別適用于環肽的合成。DEPBT是HOBt衍生的磷酸酯，其特點是產物的消旋較小。EEDQ是一經典的縮合劑,它主要是通過形成混合酸酐中間體促進多肽的合成,不足的是產物的消旋較大. 綜合分析上述碳二亞胺、磷正離子和脲正離子等幾大類型的縮合劑,以磷正離子和脲正離子型縮合劑性能最佳.無論是反應活性，還是產物的收率和光學純度方面，這兩類縮合劑都優于其它類型的縮合劑。而脲正離子型縮合劑各方面的性能在一定程度上又優于相應的磷正離子型縮合劑。盡管如此，Young's test顯示脲正離子型試劑HBTU、HBPyU和HAPyU在模擬二肽的合成中仍分別有25.4%、18.0%和13.9%的消旋。因此，設計、合成反應活性更高、產物消旋更小的新型多肽縮合劑用來高效地合成多肽以及生物活性肽仍是目前多肽合成領域亟待解決的問題。
多肽合成中常用的縮合劑有BOP reagent, PyBOP, HBTU, TBTU, HOBt,EDC·HCl等。